Jakub Sypek jest wychowankiem Sparty Paczków. Do Zagłębia Lubin trafił w 2015 roku z Orła Ząbkowice Śląskie. W pierwszym zespole 21-letni skrzydłowy rozegrał tylko 4 mecze. Więcej grał w rezerwach w III lidze, gdzie wystąpił 50-krotnie, zdobył 17 goli i zaliczył 12 asyst. Sypek ma na koncie również niezbyt udane wypożyczenie do Górnika Polkowice, w którym w 12 meczach (438 minut) zdobył 1 gola.
Z nowym klubem Jakub Sypek związał się trzyletnim kontraktem.
