Juan Muñoz przeszedł do Zagłębia Lubin przed rozpoczęciem sezonu 2023/2024 z CD Leganes. Początkowy etap lubińskiej przygody był dla Hiszpana dość ciężki, bo w okresie przygotowawczym zmagał się z urazem, jednak później ilekroć grał, to zostawiał po sobie dobre wrażenie. Niestety mała ilość szans, jakie napastnik otrzymywał od Waldemara Fornalika spowodowała, że Hiszpan nie czuł się w Lubinie najlepiej i myślał o zmianie otoczenia. Szczególnie irytujący - co w zasadzie widzieli wszyscy - był fakt, że Juan był pomijany nawet wtedy, gdy rywale w walce o skład byli w bardzo niskiej formie.
Klub dość enigmatycznie napisał w komunikacie, że "skorzystano z zapisu w kontrakcie, na mocy którego umowa została skrócona o 12 miesięcy", dlatego ciężko nie przypuszczać, że głównym inicjatorem rozstania był Juan Muñoz.
W sumie hiszpański napastnik zagrał dla Zagłębia w 27 meczach, w których zdobył 5 goli.
